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全自动氮吹仪在环境检测中主要用于样品前处理，特别适用于环境监测机构、科研院所、高校、实验室等。它能够实现样品的高效、快速预浓缩，相较于传统使用液氮吹样方法，全自动氮吹仪具有操作简便、节约人力、吹样速度更快、样品不易损失，无需经常清洗试管等优点。

在环境检测中，氮吹仪广泛应用于挥发酚、总汞、总砷、总氮、总大肠菌群等项目的检测，同时，在多氯联苯、二恶英、土壤中重金属含量的检测中也起到了重要的作用。

然而，需要注意的是，虽然全自动氮吹仪提高了工作效率，但因其价格相对较高，可能会限制其在部分基层实验室的推广使用。替代方案可以考虑使用普通实验室装备和人工替代品，如高压灭菌锅和电吹风等，但这些方法在处理某些样品时会受到限制。因此，需要根据具体样品和实验室条件进行选择。